Tras la proclamación de independencia del
estado peruano el proceso parecía estancado por la resistencia militar
española, y la inestabilidad del protectorado. Así, mientras la costa y el
norte del Perú eran independientes, la sierra peruana y el Alto Perú seguían
siendo realistas. El
virrey La Serna había restablecido su sede de gobierno en el Cuzco. Mientras el motín de Balconcillo fue el
primer golpe de Estado que hubo en el Perú y el inicio del cuadillaje militar
(Primer Militarismo); vale decir, un alzamiento de militares en Lima, el 27 de
febrero de
1823, que pidió la proclamación de José de la Riva Agüero como Presidente de la
República. Una nueva campaña militar dirigida por el general
Santa Cruz que
trata de terminar con el Ejército Real del Perú también
es derrotada.
La conclusión de la guerra en el Perú
vendría con la intervención de la Gran
Colombia. Ante la retirada del Protector, y tras
las derrotas militares del presidente Riva Agüero, el Congreso peruano decidió
solicitar en 1823 la intervención de Simón Bolívar. Bolívar ya había enviado
antes al general Antonio José de Sucre, quien
mantuvo la autonomía de las agrupaciones militares de Colombia, sin
comprometerlas en las campañas de intermedios. Bolívar tras acabar con la
resistencia de los pastusos en la batalla de Ibarra, se
embarcó y arribó a Lima el 10 de septiembre de
1823.
En 1824, desarticulado el ejército realista
por la Rebelión de Olañeta en el
Alto Perú, dio lugar la campaña militar de Junín y Ayacucho que sería favorable
a los patriotas. El Ejército Unido Libertador del Perú triunfó
en la batalla de Junín a las
órdenes del Libertador Simón Bolívar, y en labatalla de Ayacucho a las
órdenes del general Antonio José de Sucre. La capitulación de Ayacucho puso fin
al virreinato peruano.
Sucre cruza el río Desaguadero con las
divisiones de Córdova y la división del Perú del ejército libertador.13 Bastiones
y unidades realistas capitulan unas tras otras. La guerra regular en el Alto
Perú termina con el combate de Tumusla. El
gobierno del Perú (lo mismo que el rioplatense el 9 de mayo de 1825), emite un
decreto donde pide la delimitación de la fronteras y también deja en libertad a
Simón Bolívar para resolver la pertenencia del Alto
Perú a la Argentina o el Perú, o la independencia de Bolivia que fue
lo que finalmente ocurrió.
Resolución del Congreso constituyente del
Perú se deja al juicio del Libertador el establecimiento de un gobierno
provisorio en las provincias indemnización para el caso de que las Altas queden
separadas de las del Perú. Decreto del 23 de febrero de 1825:
artículo 3º: que si verificada la demarcación según el artículo constitucional resultaren las provincias Altas separadas de esta república el gobierno a quien pertenecieren indemnizará al Perú los costos causados en emanciparlas.
artículo 3º: que si verificada la demarcación según el artículo constitucional resultaren las provincias Altas separadas de esta república el gobierno a quien pertenecieren indemnizará al Perú los costos causados en emanciparlas.
La guerra sin embargo continuaría hasta su
conclusión en el año 1826 con la Campaña de Chiloé y la rendición de la fortaleza del Real Felipe.
El 4 de
septiembre de
1826, Bolívar se embarca en el bergantín "Congreso" con dirección a
Colombia y no regresaría más al Perú.